Avec le développement des vins et cidres bio, on observe une vraie tendance à la réalisation de fermentations spontanées, en laissant se développer les levures et bactéries indigènes. En effet, ces microorganismes sont parfois considérés comme des éléments du terroir qui participent à la typicité des vins et des cidres.
Pourtant, aucune connaissance scientifique ne permet d’affirmer une telle spécificité, alors que la non-maîtrise de ces microorganismes peut conduire à des difficultés de fermentation, des déviations aromatiques ou des altérations. Le projet Casdar Levains Bio s’est appuyé sur un réseau de laboratoires, instituts techniques et associations de producteurs bio pour apporter les connaissances nécessaires et des solutions pratiques pour réaliser des fermentations indigènes avec un bon niveau de maîtrise. Il a été montré qu’il existe une grande diversité de souches de la levure Saccharomyces cerevisiae et de la bactérie lactique Oenococcus oeni, que des souches sont génétiquement adaptées à certains produits, mais pas à des régions ou à des sites de production. Des protocoles ont été mis au point pour permettre de sélectionner des souches issues des exploitations ou pour réaliser des pieds de cuve de microorganismes indigènes. Certaines des solutions ont été transférées avec succès auprès des producteurs.
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