Sélection sanitaire des clones de vigne

Responsable : Laurent Audeguin

Contacts : Laurent Audeguin, Isabelle Beccavin, Véronique Tassart-Subirats, Aline Ruiz, Jean-François Mallet, Jean-Pierre Granier.

Bilan 2007

En 2007 il a été réalisé 510 indexages ligneux plantés en pépinière et 337 indexages par greffes boutures herbacées en serre.
Pour nos propres besoins de sélection, 4 105 échantillons ont été analysés représentant 10 562 tests ELISA pour les virus du court-noué, des enroulements 1, 2 et 3 mais aussi de la marbrure et du GVA.
En prestations de service pour les organismes publics et les particuliers, 12 138 échantillons ont été analysés représentant 33 036 tests ELISA essentiellement pour les virus du court-noué et des enroulements 1 et 3.
Pour la sélection et à la demande de clients, 15 clones ont été assainis par microgreffage.
A la demande de la Protection des Végétaux, 1 587 échantillons ont été testés par PCR pour les phytoplasmes de la flavescence dorée et du bois noir.

Intérêts pour la filière viti-vinicole

La sélection sanitaire permet de contrôler le matériel végétal vis-à-vis des maladies à virus aux différentes étapes de la chaîne de multiplication.
- Etape 1 : au niveau de l’établissement de sélection IFV, diagnostic de l’état sanitaire du matériel issu des prospections, puis analyses complètes des clones proposés à l’agrément. Ensuite contrôle tous les 5 ans du matériel initial dans le conservatoire et tous les 6 ans du matériel de base dans le conservatoire et chez les établissements de prémultiplication.
- Etape 2 : à la demande de Viniflhor contrôles des différentes catégories de matériel.
- Etape 3 : prestations de service auprès des professionnels soit dans le cadre des autocontrôles réglementaires soit pour toute autre demande.
Un clone ne peut être agréé que si les analyses sanitaires sont négatives pour l’ensemble des viroses retenues dans le schéma de certification. Aussi le mauvais état sanitaire de certaines variétés peut conduire à la nécessité de réaliser un assainissement par des techniques de culture in vitro afin de sauvegarder ces variétés.
A la demande de la Protection des Végétaux, responsable du contrôle des maladies de quarantaine, des analyses de dépistage des phytoplasmes permettent d’assurer une surveillance du territoire.
Le suivi sanitaire du matériel issu de sélection est permanent et est soumis à une périodicité de contrôles.

Description du programme

Motivations et objectifs

De façon récurrente la sélection sanitaire a pour objectif de contrôler l’état sanitaire des clones en cours de sélection en vue d’un possible agrément si les résultats de la sélection génétique sont favorables.
L’état sanitaire des différentes catégories de matériel : initial, base et certifié doit être régulièrement contrôlé afin d’offrir un maximum de garanties aux viticulteurs.

Protocole expérimental

Les têtes de clones issues de prospections ou de conservatoires subissent un premier screening par test ELISA des deux principales maladies : court-noué et enroulements 1, 2 et 3. Les clones positifs sont détruits. Les clones négatifs subissent alors l’ensemble des tests obligatoires en vue de leur possible agrément.
Les tests officiels sont les tests biologiques par indexage sur diverses variétés indicatrices. Les viroses obligatoires à dépister sont : court-noué, enroulement, marbrure, écorce liégeuse et cannelures sur Rupestris et sur 5BB. Pour la sélection des variétés porte-greffe deux viroses supplémentaires sont testées : nécrose des nervures et mosaïque des nervures.
Les dépistages de contrôles périodiques se font par analyses sérologiques ELISA uniquement pour les virus du court-noué et des enroulements 1, 2 et 3.
L’assainissement des clones consiste en un microgreffage en conditions in vitro d’un apex du clone candidat sur un hypocotyle de semis ou sur un embryon somatique.
Le dépistage des jaunisses de la flavescence dorée et du bois noir se font par analyses moléculaires PCR avec deux couples d’amorces.

Derniers résultats acquis

Indexages

Les indexages ligneux plantés en pépinière se répartissent de la façon suivante :
157 tests enroulement sur Merlot N.
157 tests enroulement sur Cabernet-Sauvignon N.
196 tests marbrure sur Rupestris du Lot.
Soit un total de 510 tests.

En première année d’observation 10 tests enroulement et 14 tests marbrure sont notés positifs.
En deuxième année d’observation (pépinière 2006) 3 tests enroulement (sur 96) et 38 tests marbrure (sur 173) sont notés positifs.
En troisième année d’observation (pépinière 2005) 1 test enroulement (sur71 C.S et 93 Cf) et 11 tests marbrure (sur 104) sont notés positifs.
Après arrachage de la pépinière marbrure et décorticage des plants 16 tests sont positifs RSP.

Les indexages herbacés réalisés en serre se répartissent de la façon suivante :
22 tests enroulement sur Cabernet franc N.
20 tests enroulement sur Pinot N.
23 tests marbrure sur Rupestris.
87 tests écorce liégeuse sur LN 33.
11 tests cannelures sur LN 33.
19 tests nécrose des nervures sur 110 R.
12 tests mosaïque des nervures sur Riparia Gloire.
37 tests cannelures  sur Rupestris du Lot.
106 tests cannelures sur 5BB.
Soit un total de 337 tests.

Remarques :
Les résultats de lecture de symptômes pour l’enroulement et pour les cannelures ne seront connus qu’en 2008.
9 tests GCMV sur Pinot N ont été réalisés à la demande la Nouvelle-Zélande.

Tests sérologiques ELISA

Les tests sont réalisés pour les travaux de sélection de l’IFV, pour les contrôles de VINIFLHOR et pour les particuliers en prestation de service. 

Contrats suivi de prémultiplication :    2240                      6714

Le laboratoire du Département matériel végétal de l’IFV a testé en 2007 16 243 échantillons correspondant à 43 598 analyses.
Par rapport à 2006 les tests en interne pour l’IFV sont en dimunition, par contre ils sont en augmentation pour Viniflhor, le suivi du matériel de base et pour les particuliers. Les tests pour les autocontrôles restent stables (2397 contre 2619 en 2006).

Microgreffages

L’assainissement de clones virosés par microgreffage d’apex en 2007 a été réalisé sur 15 clones :
- 2 introductions : Mourvèdre B E1 et Syrah E555.
- 2 variétés de table pour La Tapy : Benitaka et Tokay Late Red.
- 7 variétés étrangères : Assyrtico E1, Feteasca negra E1, Mavrud E1, Moschofilero E8, Nebbiolo E6, Saperavi E5 et Touriga nacional E5.
- 3 clones de Syrah pour l’étude du dépérissement : 73, 381 et 585.
- 1 porte-greffe : 125 AA clone 182. 

Tests moléculaires PCR

Pour la deuxième année consécutive le laboratoire du Département Matériel Végétal de l’IFV a été agréé par le Ministère de l’Agriculture pour effectuer une partie de la campagne de tests de dépistage des phytoplasmes de la Flavescence dorée et du Bois noir.
De septembre à décembre 2007 des échantillons de pétioles ont été fournis par le SRPV de PACA et par les différentes délégations de VINIFLHOR.

Conclusion

Les activités de contrôle du matériel agréé au Domaine de l’Espiguette ont permis de clore un cycle de 5 ans. Un nouveau cycle débutera en 2008.
Les analyses pour les autocontrôles n’ont pas progressé, contrairement aux prévisions.
Le programme d’indexage herbacé devrait être renforcé en 2008 par suite de l’arrêt du contrat de production de plants avec la variété de porte-greffe résistante au nématode vecteur du court-noué.